Elle prend sa source dans les monts Mitumba à l'Ouest de la localité de Kilumbi sur le territoire de Kalemie dans la province du Tanganyika. Elle est dans son entièreté orienté Nord vers le Sud. Elle coule parallèlement à la route nationale 5 jusqu'à la hauteur de la localité de Lukenge puis bifurque en direction Est. Elle reprend à nouveau la direction Sud jusqu'à son embouchure dans le lac Tanganyika à l'Est de l'aéroport de Kalémie.
La Rugumba est une rivière bu bassin du Tanganyika en RD Congo d'une longueur de 105 km.