Elle est un affluent majeur de rive gauche de la rivière Uele qui coule entre les provinces du Haut-Uele et Bas-Uele.
Elle prend sa source au Sud de la localité de Watsa, dans le territoire du même nom dans le Haut-Uele. Elle arrose également le domaine de chasse de Maika-Penge où elle sépare les territoires de Dungu et Rungu. Elle marque également la frontière entre ce dernier et le territoire de Niangara avant d’entrer dans la province du Bas-Uele dans laquelle elle ne draine qu'un seul territoire: celui de Poko. Elle se jette dans la rivière Uele à l’Est de la localité de Dingila après un parcours long de 514 km. son affluent la Poko est la rivière éponyme du territoire et localité Poko dans la province du Bas-Uele.
La Bomokandi est un affluent de rive gauche de l'Uele dans le bassin versant de l'Ubangi en RD Congo.
Bassin versant
Le bassin de la Bomokandi possède une superficie d'environ 25'500 km2 à cheval sur les provinces de Bas-Uele et Haut-Uele. On trouve quelques localités dont certaines sont des chefs-lieux de territoire comme Rungu et Poko. Il y a également les localités de Bomokandi, Bambili, Teli et Gombari.
Ses principaux affluents :
- Rungu
- Teli
- Poko
- Makongo
- Likandi
- Tumbi
- Obo
- Lowa
- Gamba
- Doku
- Kedi
- Gadji
- Sara
- Kilima
- Kwoko
- Kombe
- Mona
- Makeke
- Ingi
- Nekokoda