Sa source est située non loin de la source de la rivière Bomokandi sur le territoire de Watsa, dans la province du Haut-Uele. De là, elle s'écoule en direction Sud jusqu'à son franchissement de la province d'Ituri par le territoire de Mambasa. C'est au niveau de la localité de Mabukulu qu'elle prend la direction Ouest et coule parallèlement à la route nationale 4. Elle franchit laroute provinciale 430 au Nord de la localité de Mambasa et devient la limite Sud de la réserve de faune à Okapis sur près de 40 km. Elle finit par pénétrer entièrement dans la réserve où elle passe sous la route nationale quatre (RN4) près de la localité éponyme d'Epulu avant de se jeter dans la rivière Ituri.
L'Epulu est un affluent de rive droite de l'Ituri d'une longueur de 325 km dans le bassin du Moyen Congo en RD Congo.
Ses principaux affluents:
- Nduye (142 km)
- Ekongu (60 km)
- Neduka (50 km)
- Alikili (35 km)