Elle prend sa source dans la réserve de faune de Lomami-Lualaba qui est inclus dans le parc national de la Lomami. Cette source est située dans la province de Tshopo précisement dans le territoire d'Ubundu, à 491 m d'altitude. De là, elle s'écoule en direction nord jusqu'à sa confluence avec le fleuve Congo entre les villages de Batiakope et Baturu, à 420 m d'altitude.

La Lilo (rive gauche) est un cours d'eau du sous-bassin du Lualaba en RD Congo d'une longueur de 206 km. 

Il existe une autre rivière au nom de Lilo dans la rive droite du Congo.

                                                                                                           

Principaux affluents:

 

• Okwa
• Kitora
• Lokanie