La rivière Bomu prend sa source à proximité du tripoint qui constitue la frontière entre la RD Congo, le Sud-Soudan et la République Centrafricaine (RCA), à plus de 700 m d'altitude. Elle est tout au long de son cours, la frontière entre la RD Congo et la RCA . Elle a un parcours orienté est-ouest d'une longueur de totale de 966 km, ce qui en fait le 9ème cours plus cours d'eau sur le territoire de la RD Congo. La plupart des localités du bord de la Bomu se trouve du côté de la RCA à l'instar de Zemio et Bangassou mais reste des localités de taille modeste. En RD Congo, le bassin de la Bomu est également un territoire moins densément peuplé marqué par la présence d'aires protégées comme la réserve naturelle de Bomu (est et ouest). Parmi les affluents les plus importants de la Bomu, il y a côté RCA la rivière Chinko et côté RD Congo la rivière Bili.
La Bomu est la rivière éponyme des préfectures de Haut-Bomu et Bomu en RCA. Elle rejoint la rivière Uele, près de la localité congolaise de Yakoma, pour former la rivière Ubangi.
Principaux affluents de la rivière Bomu en RD Congo:
- Bili (465 km)
- Rengu (155 km)
- Asa (130 km)
- Dume (110 km)
- Bangaro (76,6 km)
- Buye (54,8 km)
- Gangia (53,7 km)
- Kabanda (42 km)
- Balinga (37 km)
- Kangu (35,9 km)
- Anda (35,8 km)
- Vungu (34,8 km)
- Aza (34,3 km)
- Tanga (34,1 km)
- Kuegu (33 km)
- Nguli (32 km)
- Balume (29 km)
- Bakanga (27,4 km)
- Lalo (27,6 km)
- Mabaga (22,8 km)