Elle prend sa source à la frontière entre les territoires de Poko et Bambesa dans la province du Bas-Uele. Sa source est située à l'Ouest de la localité de Niapu et son son cours est dans son entièreté orienté d'Est en Ouest.
C'est dans les territoires de Bambesa et Buta que la Rubi marque la limite Nord du domaine de chasse de Rubi-Tele dont elle a influencée la dénomination. Elle arrose la ville de Buta, chef-lieu de la province du Bas-Uele. Elle draine également le territoire d'Aketi où elle rencontre la rivière Tele près de la localité de Mawai. Cette rencontre avec la Tele donne naissance à la rivière Itimbiri qui se jette 262 km plus loin dans le fleuve Congo.
La Rubi est longue de 439 km et est un sous affluent du Congo dans le bassin du Moyen Congo.
Ses principaux affluents:
- Likati
- Mangbetu
- Nzula
- Kotili
- Mwongowongo
- Gwompolombo
- Upumbase
- Bali
- Mopopongo
- Yame
- Koba
- Lemoyi
- Sambala
- Mangolaba
- Kombelimoke
- Tuta