La rivière Aruwimi coule entièrement dans la province de Tshopo où elle nait de la rencontre entre les rivières Ituri et Nepoko près de la localité de Bomili dans le territoire de Bafwasende. Si l'on prend en compte la source de son affluent le plus lointain donc celle de l'Ituri, l'Aruwimi est longue de 1287 km ce qui en fait l'un des affluents majeurs du Congo dans le sous-bassin versant du moyen Congo.

Après sa sortie de Bafwasende, elle fait une incursion dans le territoire de Banalia où elle draine la ville de Banalia, chef-lieu du territoire. C'est finalement dans le territoire de Basoko près de la ville du même nom qu'elle se jette dans le fleuve Congo après un parcours long de 640 km.

Ses principaux affluents : 

• Nepoko (450 km)
• Nava (238 km)
• Ituri (650 km)
• Shari (211 km)
• Lulu (200 km)
• Bunga (141,1 km)
• Yafele
• Nebulu
• Gala
• Longele
• Alolo
• Mozogodja (90,6 km)
• Loku
• Lokwai
• Mokwanie
• Longa
• Lukua
• Lianga
• Longa-Monene
• Kalumete (79,8 km)
• Lotele
• Logoma
• Limeye
• Bulambe (32,1 km)
• Ngoho
• Alio
• Luki
• Akoka
• Etonga
• Lusazile
• Kole
• Gombode
• Lokoma
• Luele

• Nesebene